حوزه ریاست:
- معاونت توسعه منابع و پشتیبانی
- اداره کل امور اداری و پشتیبانی
- مدیریت طرح و برنامه و امور مالی
- اداره کل نظارت بر نشر و توزیع مواد آموزشی
- دفاتر
- پژوهشگاه مطالعات آموزش و پرورش
- اداره ارزیابی عملکرد و پاسخگویی به شکایات
- شورای هماهنگی علمی سازمان
- کتابخانه و مرکز اسناد و اطلاع رسانی
- روابط عمومی و امور بین‌الملل
- اداره حراست
- گروه امور حقوقی و قراردادهای سازمان
- شبکه ملی مدارس ایران(رشد)
- انتشارات مدرسه
- مدرسۀ تاریخی دارالفنون
- بنیاد ICDL IRAN